软件企业的申报程序：

1、申报企业登陆北京市经济和信息化委员会网站，点击软件企业认定和软件产品登记服务平台，按照本指南要求在线填写《软件企业认定申请书》并上传相关附件;

2、企业网上提交的材料初审通过后，按要求提交纸质材料;

3、纸质材料受理后，北京市经济和信息化委员会在20个工作日内进行审查，对申报材料有疑异时，可组织软件产业、财务等专家对申请企业进行评审;

4、北京市经济和信息化委员会根据审查情况做出认定，将认定结果上报工业和信息化部备案通过后，在市经信委网上公布结果;

5、领取证书。